CNKI查重系统是中国知网推出的一款文献查重软件，通过比对用户上传的文献与其数据库中的文献，来判断文献的原创性。在判断抄袭与引用方面，CNKI查重系统主要通过比对文献中的内容与数据库中的文献进行相似度分析。对于抄袭的文献，系统会标注出相似度高的部分，同时给出相似文献的引用信息，帮助用户判断是否存在抄袭行为。而对于引用的文献，系统也会给出相似度分析，但会标注引用的出处，帮助用户确认文献的引用情况。总的来说，CNKI查重系统通过相似度比对和引用分析来判断文献的抄袭与引用情况。

在CNKI查重系统中，抄袭与引用的判断原理主要是基于文献内容的比对分析。对于抄袭的文献，系统会将用户上传的文献与数据库中的文献进行相似度比对，标注出相似度高的部分，同时给出相似文献的引用信息，帮助用户判断是否存在抄袭行为。而对于引用的文献，系统也会进行相似度比对，但会标注出引用的出处，帮助用户确认文献的引用情况。此外，系统还会进行原创与引用的对比分析，帮助用户更好地理解文献的原创性和引用情况。综上所述，CNKI查重系统通过相似度比对和引用分析来判断文献的抄袭与引用情况，为用户提供了一定的参考依据。