CNKI查重系统通过多重安全措施保护用户隐私。首先，系统采用严格的权限管理机制，只有授权人员才能访问用户上传的文档。其次，系统使用加密技术对用户的文档进行保护，确保文档在传输和存储过程中不被窃取或篡改。此外，系统还定期对用户数据进行备份，以防止数据丢失。最重要的是，CNKI查重系统承诺不会将用户上传的文档用于其他商业用途，保证用户的隐私不被泄露。

另外，CNKI查重系统还提供了匿名上传功能，用户可以选择匿名上传文档，确保自己的身份信息不被泄露。系统还会对用户上传的文档进行自动脱敏处理，将敏感信息进行屏蔽，保护用户的隐私。此外，系统还会对用户的操作行为进行监控，及时发现并阻止任何可能的安全风险。总之，CNKI查重系统致力于为用户提供安全可靠的服务，保护用户的隐私不受侵犯。